人心，是一门深奥的科学。人会犯罪作恶，皆因被贪婪、愤怒、软弱和嫉妒等情绪支配。为了逃避刑责，人会利用谎言掩饰真相，用诡计扰乱视线，令法证工作难上加难。未破的悬案、消失的证据、迷失的困局，都是法证团队面对的一个个难关。纵然过程中会受到打击，但他们都会坚持初心，跌倒之后重新出发，不会放弃追寻真相。 《法证先锋V》的案件和布局更加让人意想不到，唯有靠着“法证部”、“法医科”及“重案组”这灭罪铁三角，秉承前四季的理念，通力合作，找出真凶，还生者公道，替死者雪冤。
落魄中年人江福生（李铭顺饰）身负债务，人生陷入低谷，意外卷入一场由神秘“清道夫”组织所引发的暴力冲突之中。“清道夫”成员隐身于民间，以香火鼎盛的百年庙宇“青和宫”为据点，专为黑白两道、政商权贵解决他们不方便出面处理的棘手麻烦事。青和宫将江福生纳入麾下，并安排他与自负、难搞的政二代薛秋楠（娄峻硕饰）搭档。这对性格南辕北辙的组合冲突不断，神秘的女清道夫沈美娜（雷嘉汭饰）总在任务中百般阻挠，更为两人增添考验。同时，青和宫的宿敌组织“夜月堂”正联合其他势力发动全面攻击，试图摧毁青和宫百年来维系的地下秩序。
三山帮堂主连烨遭遇灭门惨案，联合发小榕城警局副局长李明远，花茉莉歌舞厅老板陈蝶衣查案复仇，破获日本特务头子松井次一郎为渗透榕城制造的各种诡秘案件，对抗日本侵略者，身先士卒，保家卫国的故事。
