北原伊织来到伊豆开启大学生活已有数月——他寄居在潜水店「碧蓝之海」，和可爱的表妹古手川千纱同住一个屋檐下。表姐古手川奈奈华、成熟风情十足的滨冈梓，还有同班同学吉原爱菜也常聚在此处，本该度过一帆风顺、青春美好的校园日常！……这只是表面光景，大学生活大半时间都在和一群裸男疯闹狂欢！原因是伊织加入的潜水社团「PeekaBoo」，潜水只是副业，这群壮汉日常一丝不挂、把酒言欢胡闹作乐。长相帅气却是重度宅的今村耕平，和伊织两个人早就彻底融入社团氛围。就在这时，奈奈华拜托伊织前去帮忙：潜水店“海豚”要在帕劳开设分店，人手严重不足。但伊织想起耕平之前说过，没法实时追番所以不想出国……这个夏天，首次奔赴海外帕劳，全新的碧蓝爆笑生活正式开幕！
高一生水之江梅有着极其高超的文学造诣，文科成绩无人能及，但与之相反的是数理化等理科却差强人意，有留级甚至影响保送的风险，为此班主任平冢推荐他加入学生会，以提高其在学生之间的评价。但水之江成为学生会书记后，才发现内里都是些怪人，包括遗留内裤在学生会室的会长古都吹寿子、会敲诈男生的“雌小鬼”伪娘宣传委员尾鸟绽、看似温柔却无比腹黑的会计照井有栖、以及因受伤而住院一个月才复学的不幸少女陆奥小麻吕。水之江在这些充满个性的同学围绕之下，为了顺利毕业，正式展开学生会生涯。
